La diferencia se nota bastante. Otra cosa es que a algunos juegos les siente mejor y a otros peor, pero como mínimo llega a ser bastante apreciable.
Sin ir más lejos, y ya que en otro hilo se está hablando de la saga Ys, mira la diferencia que se da con la versión Master System del primer Ys.
PSG
YouTube Link
FM
YouTube Link
Más que pillarse una Mark III blanca, yo recomiendo hacerse con una Master System japonesa, que es el segundo modelo que salió de la consola en Japón y externamente es igual a una Master System occidental (se diferencia en el slot de cartuchos, en que el botón Reset es sustituido por un botón Turbo, y en que en vez de poner "MASTER SYSTEM Power Base" en la consola, sólo pone "MASTER SYSTEM" a secas). Precisamente la imagen de la Master System que puse ayer en el hilo de los juegos conversionados de Game Gear es de una japonesa.
Con una Mark III, tendrías que hacerte aparte con el módulo FM para acoplárselo a la consola. La Master System japonesa en cambio ya tiene el chip FM integrado en la consola.
También ha proliferado mucho en la scene desde hace unos años el modificar Master System occidentales (incluso con las Master System II se puede hacer) o incluso Mega Drives con el chip FM.